Quality study
EQA plasma cfDNA purification
The purpose of the study is to evaluate various platforms and kits for the purification of ctDNA, ensuring standardization of ctDNA purification methods and thereby enhancing the quality of ctDNA analyses in Denmark.
We seek ctDNA laboratories in Denmark to participate in the EQA.
When?
Spring 2024
Organiser
National Infrastructure 1 (NI1)
National Infrastructure 2 (NI2)
Registration
Send an e-mail to Malene Green Madsen
Who?
ctDNA laboratories in Denmark
Procedure and timeframe
In Danish
EQA studiet kommer til at forløbe således:
- Tilmelding til kvalitetsstudiet senest d. 16. februar.
- Laboratoriet i Næstved forbereder plasma prøver.
- Plasma prøver sendes til deltagende laboratorierne d. 4. marts.
- De deltagende laboratorierne oprenser ctDNA prøverne og sender dem retur til Næstved laboratoriet. Samtidig udfyldes og indsendes det tilsendte rapporteringsskema. Alt sammen senest d. 4. april.
- Næstved laboratoriet analyserer ctDNA prøverne og måler på forskellige parametre såsom udbytte, mængde af enkeltstrenget DNA, proteinase K overførsel, fragmentering osv.
- Data anonymiseres og deles med alle DCCC ctDNA laboratorier slut Q2.
Plasma prøverne vil blive tilsendt på tøris i et sæt á 5 rør for hvert oprensningskit. Hvert rør i et sæt er mærket med 1 til 5 og indeholder 5 mL plasma. Hvis et laboratorie ønsker at teste flere oprensningskit og/eller platforme er dette også muligt. Der modtages i dette tilfælde flere sæt af 5 rør.
Do you want to participate?
If you wish to participate in this EQA ctDNA quality study, please send an email to malemad@regionsjaelland.dk by February 16th, specifying the number of different purification kits you would like to test.
If you have additional questions regarding the quality study, you may also send them to the same email address.
ADDRESS FOR THE SECRETARIAT
Science Center Skejby, MOMA
Brendstrupgårdsvej 21, build. A
8200 Aarhus N
CONTACT
ctDNA@clin.au.dk
+45 78 45 53 39